V Ljudski vrt je ob prihodu prinesel novo energijo, karizmo in bogate izkušnje. Nekdanji avtoritativni kapetan slovenske reprezentance (42 nastopov) se je po evropskem prvenstvu leta 2000 poškodoval in med okrevanjem našel nov izziv: postal bo trener. Najprej je delal z mlajšimi selekcijami v Izoli, SNL pa začel spoznavati v sezoni 2004/05 kot trener Primorja. Osvojil je četrto mesto in Ajdovce popeljal na mednarodno prizorišče. Vmes je bil pomočnik trenerja Franca Fode pri Sturmu, kjer je po igranju pri Partizanu preživel najlepša leta klubske kariere, ob vrnitvi v Slovenijo pa na klopi Hit Gorice s tretjim mestom v sezoni 2007/08 omogočil Primorcem nastop za evropske pokale.
 
Trener Maribora je Darko Milanič postal 1. junija 2008 in že v prvi sezoni uresničil želje o vrnitvi naslova prvaka. Temu je dodal pokalno trofejo, superpokal in postal prvi trener v slovenskem prostoru z vsemi osvojenimi lovorikami. V sezoni 2010/11, ki so jo zaznamovale tudi odlične predstave na evropskem prizorišču, pa zbirko trofej dopolnil z novim naslovom državnega prvaka. Ekipa pod njegovim vodstvom ima prepoznaven rokopis trenerja, z opazno taktično disciplino v igri, dosežki moštva pa pomenijo najboljšo potrditev stanovitnosti na klopi. Ustvarjalno strokovno delo je ob popolni prevladi in zbiranju trofej na slovenskem prizorišču dobilo potrditev z zaporednima uvrstitvama v skupinski del Lige Europa.